Como entidade representativa, a ANJ não desenvolve nenhum programa próprio de Jornal e Educação, mas sim coordena, oferece orientações gerais, avalia e representa a soma de todos os programas de iniciativa dos jornais associados voltadas à promoção da leitura e da escrita, do fomento à educação e à cidadania ativa.

Institucionalmente, o Programa de Jornal Educação ANJ está vinculado ao Comitê de Responsabilidade Social da entidade. Sua missão é estimular, orientar, apoiar, capacitar e criar condições que levem as empresas associadas a criarem e executarem programas de leitura e cidadania utilizando seus títulos como recurso educacional mediador.

Operacionalmente, o Programa Nacional de Jornal e Educação ANJ funciona como um guarda-chuva representativo e orientativo, alinhado às cinco metas do Movimento Todos pela Educação, sob o qual se abrigam todos os projetos e programas de jornal na escola desenvolvidos pelas empresas associadas em todo o país.

Assim, o Comitê de Jornal e Educação ANJ atua como um organismo geral de fomento e disseminação de diretrizes, fundamentação e premissas nacionais que podem ou não ser absorvidas integral ou parcialmente pelos projetos de cada jornal.

As empresas associadas têm total autonomia para desenvolver seus projetos de jornal na escola, mas somente aqueles alinhados com os Recomendações Gerais nacionais recebem o selo do PJE-ANJ e o aval seus parceiros nacionais e internacionais, como Todos pela Educação e Unesco.